各インターフェイスの転送速度と書いておこう。
実際は論理値なのでこのスピードはでませんが・・・

○ USB 2.0 Full Speed 12Mbps
○ USB 2.0 High Speed 480Mbps
○ USB 3.0 5000Mbps(5Gbps)双方向
○ Fire Wire 400 400Mbps
○ Fire Wire 800 800Mbps
○ Ethernet [100Base-T] 100Mbps
○ Ethernet [1000BASE-T] 1000Mbps(1Gpbs)
○ Ethernet [10GBASE-T] 10Gbps
○ SATA-2.0 300Mbps(12Gbp)
○ PCI Express 5Gbps 双方向
○ Thunderbolt 10Gbps 双方向

ということで数値から言えば圧倒的にThunderboltですね。
ただ、その他の絡みがあるので実は何とも言えないところ。
Vienna Ensemble Proというネットワークを使って
コンピュータを音源化し、 ホストコンピュータの負担を軽くする
ソフトがあるのですが、これThunderboltを使って
音を転送すればもっとレイテンシを下げながら、
沢山の音を扱う事が出来るような気がします。
結局、音楽用I/OもThundertboltかPCI eがもっとも
沢山の音を鳴らすことが出来るんでしょうね。